단일세포 수준에서의 [[mRNA]] 안정성 및 번역 효율 변화 추적을 위한 고해상도 측정 기술

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문서 역사

본 기술은 개별 세포 내에서 mRNA의 안정성 변화와 이에 따른 번역 효율의 세포 유형별, 시간별 동태를 정량적으로 분석하기 위해 개발된 첨단 실험 및 분석 프레임워크이다.

측정 및 분석 기법

  • Single-cell RNA Sequencing (scRNA-seq) 변형: 표준 scRNA-seq에 추가하여, 각 세포에서 추출된 총 RNA 중 특정 Poly(A) tail 길이를 가진 분획만을 선별적으로 증폭/시퀀싱함으로써 전사 후 조절 정보를 확보한다.
  • Ribosome Profiling (Ribo-seq) 기반 Single-cell 접근: 세포 내 리보솜에 결합된 mRNA 조각들을 단일 세포 수준에서 분리하고 시퀀싱하여, 해당 세포의 활성 리보솜 및 번역 속도를 직접 측정한다. 이는 Translational Regulation 연구에 필수적이다.

이러한 조합적 접근은 Post-transcriptional Regulation의 복잡한 메커니즘을 세포 개체 수준에서 해부할 수 있게 하며, Biomarker 발굴에 중요한 기초 자료를 제공한다. mRNA 안정성, 번역 효율, 세포 운명 결정과의 상관관계 분석이 주요 목표이다.