종양미세환경 내 단일세포 공간 전사체 분석을 이용한 종양혈관신생 유도 세포의 공간적 프로파일링

종양미세환경(TME) 내에서 발생하는 혈관신생(Angiogenesis)은 종양 성장에 필수적이며, 이를 유도하는 세포들의 미세한 공간적 분포와 전사적 특성은 치료 표적 설정에 중요합니다.

분석 방법론

• 공간 전사체학(Spatial Transcriptomics) 기술을 이용하여 종양 조직 슬라이드 상에서 각 세포 유형의 전사체 정보를 얻습니다.
• 특히, CD31 또는 VEGFR2와 같은 혈관 관련 마커를 발현하는 세포들을 대상으로 하며, 단일세포 분석 수준의 해상도로 해당 세포들의 유전자 발현 패턴을 매핑합니다.

이를 통해 종양 혈관 내피 세포(Tumor Endothelial Cells)가 어떤 종류의 성장 인자를 과발현하며, 이것이 주변 종양 세포와 어떻게 공간적으로 상호작용하는지를 밝혀낼 수 있습니다. 이는 기존의 bulk RNA-seq으로는 불가능했던 TME의 맥락적(Contextual) 이해를 제공합니다.